Le BIE est régi par un Conseil composé de représentants de 20 Etats membres désignés par la Conférence générale de l'UNESCO.
Le rôle du Conseil consiste à préparer le projet de programme et le budget biennal du BIE, qui doit être soumis à la Conférence générale, ainsi qu'à veiller à la cohérence des activités prévues et à leur complémentarité avec la stratégie et le programme du Secteur de l'Education.
La 63ème session du Conseil aura lieu du 5 au 7 février 2014.
La session se tiendra au Bureau international d’éducation, 15 route des Morilllons, 1218 Le Grand-Saconnex, Genève.